鳥もA型インフルエンザウイルスの感染をうけます。鳥のウイルスは人のインフルエンザウイルスとは異なったウイルスのようです。鳥類のインフルエンザは「鳥インフルエンザ」と呼ばれ、このうちウイルスの感染を受けた鳥類が死亡し、全身症状などの特に強い病原性を示すものを「高病原性鳥インフルエンザ」と呼ばれています。
　通常、ウイルスは、生きた細胞の中で増殖しますが、細胞が死滅してしまうと感染力を失うと同時に死滅することが確認されています。他の一部のウイルスの様に細菌の体内に入り込み細菌と一緒になり変異を起こすことは、鳥インフルエンザウイルスの性質上考えられていないようです。これらのことから、感染した鳥は殺処分され、焼却、埋却処理されます。埋却処理では鳥インフルエンザウイルスが腐敗菌等と変異を起こし、生存することはないようです。

　高病原性鳥インフルエンザの発生が確認された場合、発生後直ちに発生養鶏場を中心として最大半径３０Kmの範囲内を移動制限地域・搬出制限区域とされ、家きん、卵、機材、飼料、排せつ物、病原体拡散の可能性のある物品の移動禁止、搬出制限、区域外への移動及び区域外への搬出が禁止されます。そして発生養鶏場では患畜の殺処分、鶏舎並びに関連施設の完全消毒が実施されます。
国の高病原性インフルエンザ防疫マニュアルにより死体は焼却、埋却及び消毒するよう指導されます。殺処分後、直ちに焼却又は埋却が行えない場合は、死体を消毒することとあります。汚染物品｛�@家きんの部分（肉、骨、臓器、羽毛）�A家きんの生産物（卵）�B家きんの排せつ物（糞、尿）�C飼料及び敷料　�D飼養管理又は防疫作業に用いた車両及び器具｝も焼却、埋却又は消毒を行うよう指導されます。

３．焼却、埋却処理について
　山口県を例にとると、防疫措置に関し、特に死亡鶏及び殺処分鶏、飼料等は埋却処理がなされました。焼却処理がなされなかった理由は、次の点を考慮されたからのようです。
�@膨大な量の鶏の死体、鶏糞、鶏卵などを焼却場に移動、搬入する必要がある。
�A野外で焼却する場合には、悪臭や煙の発生、羽毛等の汚染物の拡散等が考えられ、完全に灰の状態までにするのに、かなりの時間がかかる。周辺の火災発生の危険性も考えられる。
�Bこれらの物品の野外での焼却や焼却場へ移動することによるウイルスの拡散などの影響が考えられる。

　防疫マニュアルに記載されている家畜伝染病予防法の埋却基準及び消毒基準は次の様に規定されており、石灰の使用について明記されています。

家畜伝染病予防法施行規則
　別表第二（第二十九条、第三十五条関係）
　二　埋却の基準

＊ 消石灰による消毒の部分のみ抜粋

　三　消毒の基準　

注意　消毒の実施の基準は、次のとおりとする。
　１．畜舎の土床を消毒するには、土床に消石灰又はサラシ粉をさん布してから深さ０・三メートル以上掘り起こして、これを搬出した後、消石灰又はサラシ粉をさん布し、新鮮な土を入れ、搬出した土は、焼却又は埋却する。ただし、ブルセラ病又は家きんコレラ等の場合にあつては、消石灰、ホルマリン水、クレゾール水等を十分にさん布するだけでよい。

３．１　京都府での埋却処理及び消毒

• フレコンバッグ内には鳥の死骸等が入れられた
• 埋却溝の底面に消石灰を５cmの厚さに敷き詰められた。また実際にはフレコンを被覆したビニールシート上面にも消石灰が敷き詰められたようである。
• 山口県における埋却処理も同様な方法がとられ、現在、埋却処理はこの方法が一般的なようである。
  

＊図1,2は　「平成16年10月　我が国における高病原性鳥インフルエンザの発生と防疫措置　〜HPAIに関する防疫関連資料〜　」（財団法人　全国家畜畜産物衛生指導協会）より引用